Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap221A9Q751 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap221A9Q751 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap221A9Q751 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms