Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc9bA3KGF9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc9bA3KGF9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc9bA3KGF9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc9bA3KGF9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc9bA3KGF9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc9bA3KGF9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc9bA3KGF9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc9bA3KGF9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms