Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palm3A2TJV2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palm3A2TJV2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Palm3A2TJV2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Palm3A2TJV2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms