Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htra4A2RT60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htra4A2RT60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htra4A2RT60 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms