Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trgv2A2J008 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trgv2A2J008 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trgv2A2J008 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trgv2A2J008 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trgv2A2J008 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trgv2A2J008 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trgv2A2J008 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trgv2A2J008 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trgv2A2J008 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trgv2A2J008 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trgv2A2J008 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trgv2A2J008 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms