Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brwd3A2AHJ4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brwd3A2AHJ4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brwd3A2AHJ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brwd3A2AHJ4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brwd3A2AHJ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Brwd3A2AHJ4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Brwd3A2AHJ4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brwd3A2AHJ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Brwd3A2AHJ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Brwd3A2AHJ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Brwd3A2AHJ4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms