Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ambra1A2AH22 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ambra1A2AH22 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ambra1A2AH22 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms