Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl2A2AGA4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhbdl2A2AGA4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhbdl2A2AGA4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms