Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2aA2A9G7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2aA2A9G7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms