Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prdm16A2A935 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prdm16A2A935 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prdm16A2A935 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Prdm16A2A935 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Prdm16A2A935 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Prdm16A2A935 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm16A2A935 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms