Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hivep3A2A884 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep3A2A884 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep3A2A884 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms