Protein–RNA interactions for Protein: A2A7W1

Cd300ld4, CD300 molecule-like family member D4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld4A2A7W1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300ld4A2A7W1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd300ld4A2A7W1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300ld4A2A7W1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300ld4A2A7W1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms