Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo47A2A6H3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fbxo47A2A6H3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fbxo47A2A6H3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo47A2A6H3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms