Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25,02■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
A0A0U1RNP2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
A0A0U1RNP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
A0A0U1RNP2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms