Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms