Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trbv26A0A0B4J1P5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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