Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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