Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv21A0A0A6YX06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv21A0A0A6YX06 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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