Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28360A0A087WR25 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28360A0A087WR25 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28360A0A087WR25 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28360A0A087WR25 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms