Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms