Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf13bQ9WU72 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms