Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam50bQ9WTJ8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms