Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psma4Q9R1P0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms