Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trex2Q9R1A9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms