Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Plod1Q9R0E2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Plod1Q9R0E2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Plod1Q9R0E2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Plod1Q9R0E2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms