Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms