Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gpc1Q9QZF2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc1Q9QZF2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms