Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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