Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms