Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim44Q9QXA7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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