Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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