Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mid2Q9QUS6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms