Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms