Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dclk1Q9JLM8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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