Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gde1Q9JL56 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gde1Q9JL56 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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