Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms