Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1Q9ESW8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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