Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms