Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx6Q9ER75 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms