Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clstn2Q9ER65 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms