Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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