Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms