Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms