Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn9Q9D805 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms