Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms