Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lonrf3Q9D4H7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms