Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx29Q9D3S3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms