Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snrnp35Q9D384 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snrnp35Q9D384 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Snrnp35Q9D384 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrnp35Q9D384 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrnp35Q9D384 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snrnp35Q9D384 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snrnp35Q9D384 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp35Q9D384 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms