Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D2Q3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D2Q3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms