Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2cQ9D1C1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ube2cQ9D1C1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms