Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syf2Q9D198 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syf2Q9D198 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms